黑衣人3完结其它讲述的是：尸澄真等人拿到忍刀后准备组建新的忍刀七人众引发革命，长十郎得知后准备肃清他们，如果有必要的话神乐也难逃一劫。博人说服长十郎准备私下解决这次的叛乱，他打算把事态控制到小鬼打群架的程度，没有更好办法的长十郎决定陪博人和佐良娜一起行动，而其他同伴也偷偷跟了上去，但持有忍刀的尸澄真一行并没有那么好对付。